De las más de 130 Instituciones de Educación Superior que hay en la entidad, sólo siete están acreditadas por la Federación de Instituciones Mexicanas Particulares de Educación Superior (Fimpes) y dos más están en proceso: La Escuela Libre de Derecho de Puebla y la Universidad de la Sierra.
Las sietes instituciones que están certificadas son: La Universidad de las Américas (UDLA), el Instituto de Estudios Superiores, la Normal Superior Benavente, la Universidad Cuauhtémoc, la Universidad del Valle de Puebla, la Universidad Madero y la Universidad Popular Autónoma del Estado de Puebla (Upaep).
Según un documento enviado por Luis Olmos, secretario Ejecutivo y de la Asamblea de Fimpes al secretario de Educación Pública, Carlos Alberto Julián y Nacer con fecha 5 de mayo del año en curso, sólo la Universidad de las Américas obtuvo la acreditación lisa y llana hasta 2009.
La Upaep obtuvo la acreditación sin observaciones hasta el año 2009, lo que incluye el funcionamiento del edificio central; del CIU ubicado en Cholula; del Hospital Upaep y de la Casa de la Cultura.
El Instituto de Estudios Universitarios fue acreditado hasta 2009 pero con recomendaciones, al igual que la Universidad Madero y la Universidad del Valle, sólo que esta última deberá repetir su procedimiento hasta otoño de 2010.
La Normal Superior Benavente y la Universidad Cuauhtémoc obtuvieron su acreditación con condiciones hasta otoño de 2008 y 2010, respectivamente.
Las sietes instituciones de educación superior mencionadas fueron ratificadas como miembros afiliados acreditados de Fimpes durante la XLV Asamblea General Ordinaria que se llevó a cabo en Monterrey, Nuevo León el 30 de abril de 2004.
Las escuelas que se someten al estudio y acreditación en Fimpes se dividen en cuatro modalidades: lisa y llana, sin observaciones, con recomendaciones y con condiciones.
La acreditación Fimpes la otorga una vez que las instituciones aprueban indicadores agrupados en once capítulos: Filosofía institucional; Propósitos, planeación y efectividad; Normatividad, gobierno y administración; Programas educativos; Personal académico; Estudiantes; Personal administrativo, de servicio técnico y de apoyo, Apoyos académicos; Recursos físicos; Recursos financieros y Educación a distancia.